时间套利或持有成本套利是指在某一个时刻低价购买某种商品，在未来的另一个时刻以高价卖出该商品。金融工程学中关于远期价格的定价公式F＝S（1＋rt），就是这种套利的应用。现在买入现货并在未来出售交割，需要付出成本，即持有头寸需要资金，而资金有时间价值（此处更严格地说是时间成本），商品还有存储费用。另外，持有某类商品也可以获得某些利益。成本与利益之差即为持有该商品的净持有成本。

无套利定价理论使商品的现货与远期价格满足前面所提到的公式。如果不满足定价公式F>S（1＋rt），可以这样操作：在当期以S价格购买该商品，持有该商品到期末，以事先确定的远期价格 F 出售，F-S（1＋rt）即为套利的利润。随着中国股指期货的推出，市场上出现了名为期现套利的操作，即利用指数期货价格与标的物沪深300指数的价格差异，运用远期定价公式，或是买入（卖出）期货的同时卖出（买入）指数所对应的股票，赚取差价。由于中国的市场价格不完善，这种操作在股指期货推出后，获得了不菲的超额利润，然而这种套利操作的普遍使用，也会使此种套利难以保持持久的超额利润。

普通商品具有存储费用，这是当期价格通常较远期价格要更低的重要原因。2020年，由于受疫情影响，经济下行，需求低迷，导致国际原油期货市场出现价格为负的“奇怪”现象。究其原因，就是原油的仓储存在较大成本，现有的仓储能力无法存储多余的原油，卖方宁愿付钱给买方以减少未来可能产生的更多损失。普通商品具有存储费用，也是负利率现象出现的一个重要原因。凯恩斯在《就业、利息和货币通论》的第十七章中对商品货币性的讨论，实际上运用了金融工程的期货与现货的套利原理。