初级市场与二级市场有着紧密的相互依存关系。

初级市场是二级市场的基础，如果没有初级市场发行的金融工具，二级市场也就成了无源之水，无本之木；有了发行市场，还必须有二级市场，否则，新发行的证券就会由于缺乏流动性而难以摊销，从而导致初级市场萎缩以致无法存在。另外，二级市场的行情也会反过来影响初级市场的发行定价。例如，在股票市场行情好(牛市）的时候，初级市场新股的发行定价就会高些，反之，企业就只好以较低的价格发行新股。

初级市场是组织证券发行的市场。

凡新公司成立发行股票，老公司增资补充发行股票，政府及工商企业发行债券等，都构成初级市场活动的内容。初级市场最基本的功能是将社会剩余资本从盈余者手中转移到短缺者手中，促进储蓄向投资的转化。在初级市场上，需要筹资的企业或政府，或者自己直接，或者借助中介机构的帮助发行证券。由于中介机构有丰富的经验和大量信息，绝大多数发行均通过他们完成。中介机构包括投资银行、证券公司、律师事务所、会计师事务所。其中投资银行或证券公司的作用尤为重要。他们的作用体现在证券发行的全过程之中：帮助筹资人设计筹资方案，包括确定发行价格、发行数量、发行时间；帮助寻找律师及会计师；帮助编制有关文件；帮助推销证券。

二级市场也称次级市场，是对已经发行的证券进行流通和转让的市场。

当股东想转让股票或债券持有人想将未到期债券提前变现时，均需在二级市场上寻找买主；当希望将资金投资于股票或者债券等长期金融工具的人想进行此类投资时，可以进入二级市场，从希望提前变现的投资者手中购买尚未到期的证券，实现投资。因此，二级市场最重要的功能在于实现金融资产的流动性。正是二级市场提高了金融工具的流动性，才极大地增强了人们持有这些资产的意愿。如果没有高流动性的二级市场，一级市场的发行也会很困难。在20世纪80年代，中国发行的政府债券就因没有二级市场，要变现很困难，在这种情况下，人们购买政府债券的积极性就很低。为了完成政府债券的发行计划，政府不得不采取行政摊派这种低效率的发行方式。